A Lagoa Misteriosa fica na fundo de uma dolina, um tipo de formação geológica que parece um buraco, e é toda cercada por mata ciliar. O acesso até este lago de águas azuis é feito por uma escadaria de 70 metros.

A Lagoa impressiona por sua incrível profundidade e transparência da água,  aos 30 metros ainda é possível observar  as árvores que cercam a lagoa. Nos meses de inverno, a visibilidade chega a 40 metros.

A 8 metros de profundidade abrem-se dois poços, com cerca de 10 metros de diâmetro, que descem verticalmente para mais de 240 metros de profundidade.

O mergulho é emocionante e a sensação é de que a Lagoa não tem fim, afinal já se chegou à profundidade de 220 m em mergulho exploratório sem que o fundo fosse avistado.

Os mergulhos são planejados dentro dos limites da certificação de cada mergulhador, e devem sempre serem acompanhados por um profissional de mergulho que conduzirá toda a operação. Também existem circuitos especiais para Cave Divers.

No verão com água turva o mergulho é suspenso, sendo feito apenas mergulho técnico.

Obs: Mergulho temporariamente suspenso por determinação do IBAMA/CECAV. A Lagoa Misteriosa está em processo de licenciamento ambiental.