La Laguna Misteriosa está ubicada en la ciudad de Jardim, en el departamento brasileño de Mato Grosso do Sul, 270 km de la capital Campo Grande, 50 km de Bonito, y 36 km de Jardim.
La ruta para el paseo es la BR 267 Km 515 que es la misma ruta de acceso al Recanto Ecológico Rio da Prata.
Como llegar en la Laguna Misteriosa desde:
- Bonito: Salir por la ruta MS 178 / MS 382 (va pasar adelante al Centro de Convenções), seguir por la MS 178 durante 50 km hasta la ruta BR 267, torne a la ezquierda, rumo a Jardim. Por más 2 km, siga la placa para el Recanto Ecológico Rio da Prata, después, por más 3 km de ruta interna, llegue en la entrada señalada para la Laguna.
- Jardim: Seguir por la ruta BR 267 sentido Porto Murtinho, seguir por 36 km, tornar al señal de entrada para o Recanto Ecológico Rio da Prata, después, por más 3 km de ruta interna, llegue en la entrada señalada para la Laguna.
- Campo Grande: Seguir por la ruta BR 060 sentido Sidrolândia, pasar por Nioaque hasta Guia Lopes. Entonces, seguir por la ruta BR 267 para Jardim, seguir por 36 km, tornar al señal de entrada para o Recanto Ecológico Rio da Prata, después, por más 3 km de ruta interna, llegue en la entrada señalada para la Laguna.